第47集团军是苏联工农红军在伟大卫国战争爆发后组建的一支集团军，最初是为了保卫苏联-伊朗国境安全而建立的。

根据外高加索军区1941年7月26日发布的命令，第47集团军于8月1日正式成立，该集团军是在机械化 第28军的基础上组建的，最初编有：山地步兵第63师、第76师，坦克第6师、第54师，炮兵第116团、第456团，歼击机航空兵第347团，以及其他一些独立的部队。

1941年8月23日，新组建完毕的第47集团军被编入了外高加索方面军（同年12月30日改为高加索方面军）。8月25日，该集团军参加了与英军南北夹击并占领伊朗的军事行动，以阻止伊朗倒入轴心国阵营。

当日凌晨零点，第47集团军司令员诺维科夫少将亲自指挥一支摩托化部队渡过阿拉斯河进入了伊朗境内，经过一些规模不大的战斗，第47集团军在占领伊朗的阿塞拜疆地区以及北部的重要城市阿尔达比勒、大不里士、乌尔米耶等地后完成了这一军事行动。之后，第47集团军一直驻扎在伊朗北部地区及苏伊边境地带。

随着苏德战场形势的变化，第47集团军大部被调回了国内。1942年1月28日，第47集团军划归新成立的克里木方面军指挥，被部署在了刻赤半岛。2至4月间，第47集团军参加了克里木方面军对当面德军发动的三次攻势，试图与被围困于塞瓦斯托波尔的苏军打通联系，但均未取得成功。5月，曼施坦因指挥德军第11集团军对刻赤半岛发动进攻，第47集团军在经过激烈的防御战斗后，因战役失利而退往塔曼半岛。

1942年5月20日，退入塔曼半岛的第47集团军被编入了由克里木方面军改组而成的北高加索方面军（同年9月4日改编为外高加索方面军黑海集群），在其编成内参加了高加索战役的防御阶段作战。

8、9月间，第47集团军参加了保卫新罗西斯克的战役。8月19日，新罗西斯克方向爆发激烈战斗，德军企图以优势兵力于行进间一举占领这一黑海沿岸重要港口。在黑海舰队及海军陆战队配合下，第47集团军击退了德军这次突击。

8月28日，德军第17集团军从图阿普谢方向调来援军向新罗西斯克发起新的攻击，第47集团军虽经进行了残酷的防御作战，但一直未能完全阻挡住德军进攻的步伐。9月2日起，克里米亚半岛的德军也开始横渡刻赤海峡进攻塔曼半岛，从北面威胁到了新罗西斯克。至9月5日，德军在新罗西斯克北、东、西面三个方向的接近地带夺取了多个战略要点，9月7日，德军占领新罗西斯克火车站，接着又夺占谷仓和港口，双方进入了巷战，新罗西斯克的大部分城区落入了德军手中。

9月8日，安德烈·安东诺维奇·格列奇科少将（55年苏联元帅）临危受命接任了第47集团军司令员一职，他及时调整防御部署，在指挥部队浴血奋战阻挡德军进攻的同时，派出多支精悍小分队对德军后方及后勤补给线进行了精确的打击，以破坏德军进攻节奏。到9月11日，第47集团军在格列奇科指挥下终将德军阻止于新罗西斯克的东南部而不得寸进。双方的激战一直延续到9月26日，无法继续扩大战果的德军被迫停止了进攻行动而转入了防御，双方在这一线开展开了对峙，第47集团军的顽强防守使得德军企图从新罗西斯克一线突向外高加索地区的计划被打破。

1943年1月至3月上旬，第47集团军在重新设立的北高加索方面军编成内参加了高加索战役反攻阶段的战斗，集团军所属兵团和部队在新罗西斯克-克雷姆斯克方向实施了一系列进攻战役。期间，该集团军曾向克雷姆斯卡亚镇方向发动了进攻战斗，其部分兵力还参加了在勃总著名的“小地”上的作战行动。

1943年3月中旬，第43集团军受命将所属部队分别调拨给了友邻的第18集团军和第56集团军，而集团军野战领率机关则被调入了北高加索方面军预备队，而后部署在了迈科普一带准备接收新的部队。3月21日，第43集团军又被调往了最高统帅部大本营预备队，集结于罗索希（沃罗涅日州城市）一带接收了新的部队。

4月10日，第47集团军被编入预备队方面军（4月15日改称草原军区、7月9日改称草原方面军）以准备参加库尔斯克突出部的作战。8月1日，在苏联红军取得了库尔斯克会战防御阶段的胜利而转入进攻时，第47集团军被转隶给了沃罗涅日方面军（10月20日改称乌克兰第1方面军）以参加别尔哥罗德-哈尔科夫战役，战役期间，第47集团军在红军航空兵的配合下在阿赫特尔卡北面击退了德军3个装甲师的反突击，使得战役的胜利得到了保障。之后，该集团军又连续参加了解放左岸乌克兰地区的一系列战役。